在非常早的时候，一个叫米兰达的女性的女儿Eva在西班牙大流感的时候死了，这个母亲在机缘巧合下发现了一种能吸收逝者意识的真菌，也就是七代的E菌的前身，开始了尝试用真菌复活女儿的研究

然后就是万恶之源的，斯宾塞，他在很年轻的时候是本代boss米兰达的学生，米兰达教给了他很多知识，但最终，斯宾塞认为米兰达所做的一切只是为了复活一个死人，而他自己的愿望是全人类的进化，二人理想不合，同时，真菌本身的感染速度达不到他的期望(他需要指数级的增长，而哪怕是后来的E菌，完全感染一个人需要的时间也在数周以上)，因此斯宾塞不告而别，并最终发现了更符合他的理想的工具——始祖病毒，转而和亚历山大与威廉等人创建了安布雷拉。但米兰达本身也确实让斯宾塞受益良多，也算是为了纪念这个老师，斯宾塞用真菌发现地的地下洞穴中的刻画符号作为了安布雷拉公司的标志，著名的伞logo。视角回到米兰达这边，她借用真菌和自己开发的一种寄生虫控制了周围的村民加以实验，以找到能让女儿Eva复活的容器，但过了近百年仍没走到最后一步。这时候某个组织(也就是七代的联盟connnections)联系上了米兰达，米兰达提供给了他们自己女儿的DNA和真菌，但联盟也只是造出了另一个失败品伊芙琳(七代剧情)。

但虽然伊芙琳失败了，E菌感染的七代男女主却带来了可能性：他们的女儿Rose在筛选之下反而成为了米兰达寻找多年的完美宿主，于是米兰达亲自潜入了伊森家里捉走了米娅，并自己化装成米娅潜伏到了伊森身边，意图测试Rose的适配性，这个行动被蓝伞发现，才有了克里斯闯入伊森家中射杀“米娅”的剧情(但米兰达还是成功逃脱了)

然后就是八代的主体故事，伊森闯入了米兰达控制的村子狼挡杀狼虫挡杀虫，干掉了四个家主(米兰达失败的试验品)，过程中也帮助证明了Rose是完美的真菌宿主，最后干掉了米兰达。